Управление муниципальным бюджетным учреждением «Информационно-методический центр» осуществляется на основе сочетания принципов единоначалия и коллегиальности. Единоличным исполнительным органом МБУ «ИМЦ» является заведующий, который осуществляет текущее руководство деятельностью МБУ «ИМЦ».

В целях координации деятельности МБУ «ИМЦ» и повышения качества предоставления услуг действует орган самоуправления - Методический совет МБУ «ИМЦ», который является коллективным профессиональным органом, объединяющим основных работников МБУ "ИМЦ" и осуществляющим свои функции на правах совещательного органа.

Положение о Методическом совете муниципального бюджетного учреждения "Информационно-методический центр". (Приказ МБУ "ИМЦ" №23 от 08.04.2020 г.)

МБУ "ИМЦ" структурных подразделений и филиалов не имеет.